A beagle viszonylag egészséges fajta, de ha a tulajdonos származási papírok nélküli kiskutyát vásárol, örökletes betegségei lehetnek. Általában az emberek egy szukát engednek beengedni minden alkalommal, amikor a legnagyobb hasznot érik. Még a genetika alapjait sem ismerik, és gyakran rokonokkal párosodnak. A kölyökkutyák szülei gyakran szenvednek alultápláltságtól, nincsenek orvosi ellenőrzés alatt, és nem érintkeznek idegenekkel. Az ilyen körülmények között lévő kiskutyákat olcsóbban és nagyon hamar eladják. Ha egy kiskutyát vásárol a kennelből, a tulajdonos megtakarítja az állatorvosi költségeket, amelyek gyakran nagyon magasak.
A beagle-ben megnyilvánuló betegségek a leggyakoribb szembetegségek és az izom-csontrendszer betegségei. A szembetegségek közül a beagle-t befolyásolhatja glaukóma, harmadik szemhéj prolapsus, distichiasis, progresszív retina atrófia. Mozgásszervi betegségek: csípő dysplasia, patella luxation. Ezeken a betegségeken kívül a beagle-t befolyásolhatja az intervertebrális lepedék károsodása, az epilepszia vagy a hypothyreosis.
Glaukóma esetén bőrpír, szemváladék, irritáció és fehéres bevonat figyelhető meg a szemen. Néha, még a terápia során is, a kutya megvakulhat.
A distichiasis a szemet irritáló második szempillasorban nyilvánul meg. Ez idegességet, szemgyulladást, és ha nem kezelik, akár vakságot is okoz.
A harmadik szemhéj, más néven Cseresznye szem eldugulása a harmadik szemhéj vörösségével és duzzadásával jelentkezik a szem belső sarkában, amely meggyre hasonlít. Gyakran szükség van műtétre.
A hipotireózis a pajzsmirigy olyan betegsége, amelynek funkciója csökken. A pajzsmirigyhormonok számos folyamatot befolyásolnak a szervezetben, és ezeknek a hormonoknak az elégtelen termelése bizonyos betegségeket okoz. A kutyák pajzsmirigy alulműködése alopeciával, hajhullással, bőrbetegségekkel, elhízással, epilepsziával, letargiával nyilvánulhat meg.
A csigolyaközi plakkbetegség a hát, a nyak, a vizeletinkontinencia, a széklet, a bénulás és a gerincvelő összenyomódása miatti érzésvesztés formájában nyilvánul meg. Az intervertebrális lemez megnyomja a gerincvelőt, és a tünetek a kompresszió mértékétől függően jelennek meg.
Beagles szteroidra reagáló meningoenceceitisben is szenvedhet. Az agyhártya és az agy gyulladása nyilvánul meg, amelyen a tünetek függenek. A leggyakoribbak a merevség, az étkezés megtagadása, járási problémák, feszültség, görnyedt testtartás.
Mindezek és sok más betegség esetén jobb, ha egy kölyökkutyát minőségi tenyésztéssel választanak, és minőségi és kiegyensúlyozott étrendet biztosítanak számára.