elemeket
absztrakt
A genomiális kópiaszám (CNV) változásai erőteljesen érintettek, mint az elhízás fontos genetikai tényezői. Egy nemrégiben végzett genomszövetségi tanulmány az rs12444979 új változatát azonosította, amely magas kötési egyensúlyhiányban van a CNV 16p12.3-mal, az európaiak elhízással való összefüggése érdekében. A tanulmány célja a CNV 16p12.3 és az elhízás fenotípusok, köztük a testtömeg-index (BMI) és a testzsír közötti kapcsolat közvetlen vizsgálata volt.
Az alanyok többnemzetiségű mintát alkottak, 2286 független alany az európai lakosságból és 1627 független han alany a kínai lakosságból. A testzsír súlyát kettős röntgenabszorpcióval mértük.
az eredmények:
Az Affymetrix Genome-Wide Human SNP Array 6.0 segítségével közvetlenül detektáltuk a CNV 16p12.3-ot 27, 26 ill. 0, 8% az európai és a kínai populációban. Jelentős összefüggést igazoltunk e CNV és az elhízás között (BMI: P = 1, 38 × 10 −2; testzsír-tömeg: P = 2, 13 × 10 −3) az európai populációban. A kisebb példányszámok alacsonyabb BMI-vel és testzsír-tömeggel társultak, és a hatás nagyságát 0,62 (BMI) és 1,41 (testzsír-tömeg) becslések szerint értékelték. Nem figyeltünk meg azonban jelentős asszociációs jelet a kínai lakosság számára, és ennek a CNV-törlésnek a gyakorisága meglehetősen eltérő az európai és a kínai populáció között (P 1, 2). Az index (BMI) a legszélesebb körben használt fenotípus az elhízás felmérésére a könnyű mérés miatt. A BMI mellett a testzsír-tömeg is használható kiegészítő fenotípusként az elhízás jellemzésére. E fenotípusok meghatározói az az elhízás patogenezise.
az eredmény
Asztal teljes méretben
Asztal teljes méretben
A CNV 16p12.3 fenotípus-különbségei az európai mintában.
Teljes méretű kép
A kínai minta esetében azt tapasztaltuk, hogy ennek a CNV-törlésnek a gyakorisága eltér az európai mintában előforduló gyakoriságtól (P 2 -teszt). Csak 13 egyedet (0,8%) találtunk heterozigóta delécióval. A legtöbb alany vad típusú volt, két példányszámmal (99,2%). Nem találtunk szignifikáns kapcsolatot ezen CNV és a BMI és a testzsír súlya között (2. táblázat). Az SNP rs12444979 jelöléshez a kínai mintában nincs polimorfizmus.
vita
Egy nemrégiben végzett nagyszabású GWAS új változatot, az rs12444979-et azonosított, amely magas kötési egyensúlyhiányban van a CNV 16p12.3-mal, az elhízással való összefüggés érdekében. 18 A deléciós allélt T allélként jelöltük, az rs12444979 allél gyakorisága 0, 13. Ez a tanulmány közvetett bizonyítékot szolgáltatott a CNV 16p12.3 és az elhízás közötti összefüggésre, mivel a CNV azonosítása SNP jelölésen alapult. Vizsgálatunk során sikeresen kimutattuk a CNV 16p12.3-at az Affymetrix Genome-Wide Human SNP Array 6.0 segítségével, amelyet a közös CNV-k detektálására terveztek, és amely közvetlenül megerősítette a CNV-fenotípus és az elhízás közötti jelentős összefüggést az európai populációban. Eredményeink igazolták az eredeti megállapítás érvényességét, és tovább alátámasztották a CNV 16p12.3 potenciális hozzájárulását az elhízás patogeneziséhez.