- elemeket
- absztrakt
- bevezetés
- az eredmény
- Az Y-kromoszómák haplocsoportjainak eloszlása
- Népességi viszonyok
- Hálózati előrejelzések és időbecslések
- vita
- Dél-Közép-Ázsia hatása Afganisztánban
- Hasonlóság az afganisztáni és pakisztáni Pathans között
- A Pathans eredetéről
- következtetés
- További információ
- Képfájlok
- További 1a. Ábra
- További 1b. Ábra
- További 2a. Ábra
- További 2b. Ábra
- További 3. ábra
- További 4a. Ábra
- További 4b. Ábra
- Word dokumentumok
- További képmondák
- 1. kiegészítő táblázat
- 2. kiegészítő táblázat
- 3. kiegészítő táblázat
- 4. kiegészítő táblázat
- Excel fájlok
- 5. kiegészítő táblázat
Videó: Rory Stewart: Ideje befejezni az afganisztáni háborút (2021 február)
elemeket
absztrakt
A CA, ML és AMOVA szempontjából elemzett populációk földrajzi elhelyezkedése. A populáció leírását lásd az 1. táblázatban található hivatkozásokban.
Teljes méretű kép
Afganisztán hivatalos nyelvei, a dari és a pastu indoeurópai eredetűek, és tadzsikok, patánok vagy pasztunok beszélik őket. A patánok elsősorban a Hindu Kush-hegységtől délre élnek, és Afganisztánban a legelterjedtebb etnikai csoportot alkotják (42%), a szomszédos Pakisztán lakosságának körülbelül 15% -át teszik ki. Bár a patánok számára különböző eredeteket javasoltak, ideértve a görög és a zsidó származást, 3, 4 ezeket az összefüggéseket nem bizonyították, és csak néhány tanulmány jellemzi ennek a csoportnak a genetikai szerkezetét Pakisztánban, 5, 6, 7, 8, 9 Afganisztánban . 10 és India 11 jelent meg.
A rendelkezésre álló genetikai adatok korlátozott mennyisége miatt ezt a vizsgálatot nagy felbontású bináris Y-kromoszóma markerek alkalmazásával végezték el először az afgán patánok genetikai sokféleségének meghatározására. A kapott adatokat ezután összehasonlították a korábban publikált földrajzi és etnikailag orientált világpopulációkkal annak érdekében, hogy megvizsgálják a modern emberek közép-ázsiai szétszóródásának apai jeleit. Ezenkívül értékeltük az afgán és a szomszédos pakisztáni patánok genetikai affinitásait, valamint feltételezett filogenetikai kapcsolatukat a görög és a zsidó populációval.
az eredmény
Az Y-kromoszómák haplocsoportjainak eloszlása
Az összesen 116 tipizált bináris marker közül 25 apai vonalat azonosítottunk 190 afgán hímben, ezek közül 11 észak-afganisztáni, 22 pedig a déli gyűjtemény volt megfigyelhető (2. ábra), ami a déli régió viszonylag magasabb genetikai sokféleségét jelzi . a Hindu Kush-hegység észak felé néz. Ezt a megállapítást azonban enyhíteni kell, figyelembe véve a két gyűjtemény mintaméretének különbségét. Összességében csak az R1a1a * -M198 (62,1%), az L3 * -M357 (7,4%) és a G2c-M377 (5,3%) haplocsoportok mutatják a frekvenciát> 5% és együttesen alkotják az afgán apa génállományának csaknem háromnegyedét.
A jelenlegi vizsgálat során vizsgált afgán egyének többsége az R-M207 haplocsoportba tartozik (67,4%), az északi (50%) és a déli (65,8%) gyűjteményekben egyaránt túlsúlyban vannak az R1a1a * -M198 alcsoportok (2. ábra). az R1a1a-M198 (1a. kiegészítő ábra) és R1a1a * -M198 (1b. ábra) kontúrtérképeken is tükröződik. Érdekes megjegyezni, hogy az R2a-M124 parallaxis elágazása észak-afganisztáni régióban szignifikánsan nagyobb arányban figyelhető meg (11,4%) a déli irányhoz képest (2,1%), és hogy az R2 * -M479 (0,7%) és az R1b1a2a - haplocsoportok Az L23 (0,7%) kimutatható, bár alacsony frekvencián, kizárólag az ország déli régiójában.
Az L-M20 haplocsoport (9,5%), amely a második leggyakoribb ebben a tanulmányban, jelentős eloszlási különbségeket mutat a Hindu Kush mindkét oldalán, Afganisztán északi részének 25% -a, míg a déli férfiak csak 4,8% -a. Pontosabban, az L3 * -M357 paragrupp képviseli az L-M20 kromoszómák nagy részét mind az északi (20,5%), mind a déli (4,1%) gyűjteményben, amint azt a 2a. (L-M20) és a 2b. . (L3-M357) Afganisztánban és a környező régiókban.
A G-M201 haplocsoportról, amely az afgán génállományban átlagosan 7,9% -os gyakorisággal fordul elő, a Kaukázusban magas gyakorisággal számolnak be (pl. A Digora osétáknál 74%) 32, és úgy gondolják, hogy neolitikus terjeszkedéssel jár együtt. . az egész régióban. 33 Bár a G2c-M377 a második leggyakoribb haplocsoport Dél-Afganisztánban (6,2%), az északi népességnél lényegesen alacsonyabb (2,3%). A G2a * -P15 alterület kivételével, amelyet északon (2,3%) és délen (1,4%) figyeltek meg, a fennmaradó G (G2a1 * -P16 (0,7%) és G * -M201 ( 0, 7%)) kizárólag a déli tartományokban találhatók. Hasonlóképpen a C-M216 (3,4%) és a Hla * -M82 (4,1%) haplocsoportok déli egyedekre korlátozódnak. További informatív haplocsoportok, amelyek északon és délen közösek, a J-M304 és a Q-M242. Északon a fenti haplocsoportokat a J2a * -M410 (2,3%), a J2a3-M68 (2,3%) és a Q1a3 * -M346 (4,5%) mutációk határozzák meg. Ezzel szemben a dél-afgánokat öt alcsoport jellemzi a J-M304 haplocsoportban (azaz J1 * -M267, J2a * -M410, J2a5-M158, J2b1-M205 és J2b2-M241), valamint a frekvenciát.
( a ) Az NTSYSpc 2.02i szoftver (Applied Biostatistics Inc., Setauket, NY, USA) felhasználásával, Y-kromoszóma haplocsoportokon alapuló CA. A populáció rövidítéseit az 1. táblázat tartalmazza. ( b ) MDS grafikon a haplotípus frekvenciák R1a1a-M198 Rst távolságain alapulva a Pathans, Ashkenazi zsidók, görögök, indiánok és pakisztániak mintáinak hathlotypes típusain. Az MDS elemzéséhez Stress = 0, 06142. A populációs kódok a következők: NAFG = Pathans Észak-Afganisztánból, SAFG = Pathans Dél-Afganisztánból, PTHP = Pathans Pakisztánból, RUS = Oroszok (Oroszország déli része, Délnyugat-Oroszország, Északnyugat-Oroszország és Uráli Oroszország), GRE = görögök, ASH = askenáz zsidók, IND = India és PAK = Pakisztán. Az elemzés során használt populációkat az 1. kiegészítő táblázat sorolja fel.
Teljes méretű kép
Asztal teljes méretben
Az R1a1a-M198 haplotípusokon alapuló MDS grafikont (3b. Ábra) készítettünk az afganisztáni és pakisztáni patánok közötti genetikai affinitások vizsgálatára számos más releváns referenciapopuláció mellett (1. kiegészítő táblázat). A 3b. Ábrán az afganisztáni és pakisztáni patánok egymás közelében állnak összeesküvésben a jobb alsó negyedben, míg India, Pakisztán és Oroszország népessége szabadon gyülekezik a grafikon jobb felső sarkában. Ezzel szemben Ashkenazi zsidó gyűjteménye a bal felső negyedben található, amely távol áll az elemzésben szereplő összes többi populációtól.
Hálózati előrejelzések és időbecslések
A 4a. Ábra egy MJ hálózatot mutat be, amely Eurázsia-szerte különböző régiókból származó R1a1a * -M198 egyedek 8 lokuszos Y-STR profilján alapul. A leggyakoribb haplotípust (DYS 19 * 16, DYS 389I * 13, DYS 389II * 17, DYS 390 * 24, DYS 391 * 11, DYS 392 * 11, DYS 393 * 13 és DYS439 * 10) 5 (11, 3)%) észak-afganisztáni és 35 (24%) afgán a déli gyűjteményből. Ezzel szemben a második leggyakoribb haplotípus (DYS 19 * 16, DYS 389I * 13, DYS 389II * 17, DYS 390 * 25, DYS 391 * 11, DYS 392 * 11, DYS 393 * 13 és DYS 439 * 10) fordul elő Afganisztán északi részén (6, 8%) a déli gyűjteményhez képest (4, 8%), és Oroszország, Ukrajna, Szlovákia és Törökország között is előfordul. Érdekes módon a harmadik leggyakoribb haplotípus (DYS 19 * 16, DYS 389I * 13, DYS 389II * 17, DYS 390 * 25, DYS 391 * 10, DYS 392 * 11 és DYS 393 * 13) az R1a1a-M198 vetületben ( A 4a. Kiegészítő ábra főként a nyugat- és kelet-európaiak (4,1%) és a dél-afganisztáni (3,4%) askenázi zsidók között oszlik meg, az észak-afganisztáni személyektől azonban hiányzik.
a ) Az R1a1a * -M198-ra elemzett populációk hálózati vetülete nyolc lokusz felbontással: DYS 389I, DYS 389II, DYS 390, DYS 391, DYS 392, DYS 393, DYS 19 és DYS 439. b ) Az L-M20 szempontjából elemzett populációk hálózatának vetülete nyolc lokusz felbontással: DYS 389I, DYS 389II, DYS 390, DYS 391, DYS 392, DYS 393, DYS 19 és DYS 439. Az elemzéshez használt populációk: az 1. kiegészítő táblázat tartalmazza.,
Teljes méretű kép
A 4b. Ábrán a leggyakoribb haplotípus (DYS 19 * 14, DYS 389I * 12, DYS 389II * 16, DYS 390 * 22, DYS 391 * 10, DYS 392 * 14, DYS 393 * 11 és DYS 439 * 13) a vizsgált L-M 2 O egyedek 7 (2,3%) dél-indiai és 12 (13,2%) dél-pakisztáni mintából állnak. Csak egy észak-afganisztáni egyén (2, 3%) osztja ezt a haplotípust. Egy másik domináns haplotípus L-M20 (DYS 19 * 14, DYS 389I * 12, DYS 389II * 16, DYS 390 * 22, DYS 391 * 10, DYS 392 * 14, DYS 393 * 11 és DYS 439 * 12) kizárólag megosztott 12 (4, 0%) egyén Dél-Indiából és 3 (3, 3%) Dél-Pakisztánból. Az L3-M357 alapú hálózati elemzés nem volt informatív az összehasonlításra rendelkezésre álló egyedek és populációk korlátozott száma miatt (További 4b. Ábra).
Az 5. kiegészítő táblázat az koaleszcencia idő becslését tartalmazza az Y-STR változatosság, valamint az L-M20, L3-M357, R1a1a-M198 és R1a1a-M198 és R1a1a-M198 haplotípusokhoz kapcsolódó haplotípus-változatok alapján Afganisztánban és más referenciapopulációkban. Ezenkívül elvégeztük az L3 * -M357 haplotípus-variánsainak idő- és varianciaszámítását az észak- és dél-afganisztáni vizsgált populációkra. Az R1a1a-M198 esetében az evolúciós időbecslések hét Y-STR lókuszon alapulnak a 7, 8 ± 2, 2 kya afganisztáni populációk számára. Ennek a haplocsoportnak a legrégebbi dátumai Pakisztánban (19, 1 ± 2, 9 kya) és Indiában (17, 9 ± 3, 7 kya) figyelhetők meg. Becslések szerint az északi (14, 6 ± 7, 3 kya) és a déli (17, 8 ± 8, 4 kya) L-M20 Haplogroup északi ideje idősebb, mint Pakisztánban (26, 3 ± 5, 3 kya) ). Az L3-M357 és Ra1a1 * -M198 figyelembevételével ugyanaz a relatív életkor-minta figyelhető meg a fenti populációkban, régebbi dátumokat Pakisztánban és az indiai szubkontinensen találunk.
vita
Bár mindkét afgán populációt túlnyomórészt az R1a1a * -M198 vonalak jellemzik, mindkettő különbözik a fennmaradó haplocsoportok megoszlásában. Dél-Afganisztán 22 polimorf bináris markert képvisel, amelyek közül 14 hiányzik az északi régióból (2. ábra), ami a populáció genetikai sokféleségének csökkenését jelzi. A csökkent sokféleség lehetséges magyarázata lehet a Hindu Kush-hegy jelenléte, amely irányított gátként szolgálhatott a génáramlás előtt.
Dél-Közép-Ázsia hatása Afganisztánban
Másrészt feltételezték, hogy az L-M20 Haplogroup Indiából vagy a Közel-Keletről 37 származott, körülbelül 30 kya-val. Erről az indikátorról, amely Észak-Afganisztán 25% -án, délen 4,8% -án található, korábban nagy gyakorisággal (48%) számoltak be a dél-indiai Kallar közösségben 33, valamint a másik (35%) népességben. Izraeltől. 38 Az L-M20 vonalakon belül levő hét Y-STR lokusz alapján generált időbecslések Afganisztán északi (14, 6 ± 7, 3 kya) és déli (17, 8 ± 8, 4 kya) populációira a pakisztáni (26, 3 ± 5, 3 kya) és az indiai (7, 5) ± 1, 7 kya populációk (5. kiegészítő táblázat). Pakisztán továbbá nagyobb haplotípusok (0, 548) diszperzióját mutatja, mint India (0, 118), ami arra utal, hogy az L-M20 valószínűleg inkább a mai Pakisztánból származik, mint Indiából. Ezenkívül az észak- és dél-afganisztáni populációk (11, 4 ± 5, 0 kya) összevonásakor az L3-M357 vonalakra generált fejlesztési időbecslések (5. táblázat) összehasonlíthatók a Pakisztánra kiszámított becslésekkel (10, 8 ± 3, 8 kya) és magasabb, mint India (5, 2 ±) 2, 4 kya) hét lókusz felbontásban. Ez a megállapítás alátámasztja azt a nézetet, hogy az L3-M357 alagút afgán vagy pakisztáni eredetű, majd délre terjed Indiáig.
Hasonlóság az afganisztáni és pakisztáni Pathans között
Vizsgálatunk bemutatja az afganisztáni és pakisztáni Pathans közötti szoros genetikai kapcsolatokat. A két régió patatánjai közötti kapcsolat várhatóan figyelembe veszi, hogy a Durand-vonalat, amely 1893 óta létrehozta Afganisztán délkeleti határát, aggodalommal kényszerítették a törzsi és etnikai hovatartozásra. A CA (3a. Ábra) és az ML (3. kiegészítő ábra) elemzése alátámasztja ezt a genetikai hasonlóságot, mivel Afganisztán északi és déli részén a klaszter Pakisztán közelében fekszik. Az északnyugat-pakisztáni Peshawarban élő 41 patánból származó további haplotípus adatok 5 felvétele (elérhető az YHRD adatbázisban) arra utal, hogy a leggyakoribb hét lokuszos haplotípusuk (29,3%) megegyezik modális haplotípusunkkal, megerősítve az útvonalak genetikai hasonlóságát Afganisztánból és Pakisztánból. Ez a filogenetikai kapcsolat hasonlóan nyilvánvaló az MDS-grafikonon (3b. Ábra), ahol mindhárom Pathan-populáció közel van egymáshoz. Az R1a1a-M198 hálózati vetületben is (4a. Kiegészítő ábra) ezek a populációk különböző haplotípusokkal rendelkeznek. Az L3-M357 és a Q1a3-M346 haplocsoportok jelenléte mindkét afganisztáni és pakisztáni patanában 8, 9 tovább segíti az e két régióból származó patanák közötti genetikai kapcsolatokat.
A Pathans eredetéről
7%), 42 megegyezik a fenti hipotézissel.