A Gérardmer és Mulhouse közötti 170 kilométeres út utolsó harmadában az Omega Pharma-Quick Step pilótája átvette a vezetést, és félelem nélkül 4:09:34 óra alatt megérkezett a célba.
Vincenzo Nibali vasárnap után elvesztette az összesítés ideiglenes vezető pozícióját, akinek le kellett mondania a sárga pólóról Tony Gallopin javára. A házi versenyző, Lotto Belisol lett az első francia, aki 2011 óta vezeti a besorolást, csak Thomas Voeckler mögött.
Nibali egy hete áll az élen a második szakasz óta. A zöld mezért elért pontszerző versenyben az első hely rettenthetetlenül a szlovák Peter Sagané, a legjobb hegymászó Nemec Martin. Sagan a 9. szakaszban a 109. helyet szerezte meg, a rajt második szlovákja Peter Velits 58. lett.
Már a 2. kategória első emelkedőjénél a Col de la Schlucht-nál a peloton bomlani kezdett. Az első hegyi bónusz mögötti síkságon Martin és De Marchi megmenekült, és fokozatosan növelte előnyét a főcsomaggal szemben. A nyitó domb viszont elbátortalanította a Kittel által vezetett korcsolyázók egy csoportját, akik kezdettől fogva lassú tempót választottak, és a második emelkedőn öt percet veszítettek a peloton. Martin, De Marchi növelte előnyét az élen. Ez utóbbi azonban két szelíd dombra telepedett le, amelyeket Martin előtt megmászott, és a teljes pontszerzést bónuszokkal vette fel.
Kevesebb, mint 60 km-rel a cél előtt az elit időmérő Martin elindult, és fokozatosan megszabadult a verseny élén álló kollégájától. Zsákmánya a későbbi 1. kategóriás hegyi prémium volt a tizenegy kilométeres emelkedő tetején, több mint 5 százalékos emelkedéssel a Le Markstein-en, amikor 10 pontot szerzett a legjobb hegymászó versenyének értékelésében.
Az üldözők csoportja Rolland és szülőanyja, Gallopin vezetésével több mint három percet vesztett Martintól, a fő peloton Velits-szel és Sagannal nyolc és fél perces rövidség volt, miután leért a dombról. A sárga trikó felvételének lehetőségét teljes mértékben kihasználta Gallopin, aki elszakadt a csoport többi versenyzőjétől, és 1:34 perces előnyt szerzett Nibali másodjára. A célegyenesben Martin félelem nélkül az első helyen végzett, így elnyerte a Tour második szakaszának babérját.
9. szakasz, Gérardmer - Mulhouse (170 km):
1. Tony Martin (Nem./Omega Pharma - Quick-Step) 4:09:34 h, 2. Fabian Cancellara (CHE/Trek), 3. Greg Van Avermaet (Bel./BMC Racing), 4. Tom Dumoulin ( Hol./Giant), 5. Matteo Montaguti (Tal./AG2R), 6. Jose Joaquin Rojas (Šp./Movistar), 7. Steven Kruijswijk (Hol./Belkin), 8. Mickael Cherel (Fr./AG2R), 9. Brice Feillu (Fr./Bretagne), 10. Tiago Machado (Por./NetApp) mind +2: 45 perc. 58. Peter VELITS (SR/BMC Racing), 109. Peter SAGAN (SR/Cannondale)
Folyamatos osztályozás a 9. szakasz után: 1. Tony Gallopin (Fr./Lotto) 38:04:38 h, 2. Vincenzo Nibali (Tal./Astana) +1: 34 perc, 3. Machado +2: 40, 4. Jakob Fuglsang (Dánia/Astana) ) +3: 18, 5. Richie Porte (Aus./Team Sky) +3: 32, 6. Michal Kwiatkowski (Lengyelország/Omega Pharma - Quick-Step) +4: 00, 7. Alejandro Valverde (Šp./Movistar ) +4: 01, 8. Pierre Rolland (Fr./Europcar) +4: 07, 9. Alberto Contador (Šp./Tinkoff - Saxo) +4: 08, 10. Romain Bardet (Fr./AG2R) + 4: 13