A Jupiter a Naprendszer legnagyobb bolygója, csak a Nap nagyobb. A bolygó térfogata 1130-szor nagyobb, mint a Földé, és 813-szor nehezebb. A Naprendszer kialakulása során a jelenleginél tízszer nagyobb térfogatú volt, a gravitációs összehúzódás miatt felmelegedett, és egy új emelkedő csillagra hasonlított. A Jupiter belsejében a nukleáris reakciók azonban nem tudtak fennmaradni, ahogyan ez a Nap esetében is történik. Ha ez nem történne meg, a Jupiter bináris csillaggá válna, és a Naprendszer lényegesen különbözne attól, amit ma ismerünk. Fokozatosan a bolygó ráncosodott, fényereje csökkent. De most ugyanannyi energiát sugároz belülről is, mint amennyit a Naptól kap. A Jupiter nagyon erős mágneses tere azt sugallta, hogy a bolygónak vasmagja van.
Átfogó kutatások után azonban kiderült, hogy a mágneses tér közepe 10 000 km-re van a bolygó közepétől, és 11 ° -kal dől el a forgástengelytől. Ez a pont egyben a Jupiter magnetoszférájának középpontja is. 10 millió kilométeres távolságig terjed. Körülbelül a távolság felében a magnetoszféra hőmérséklete a legmagasabb, körülbelül 17-szer magasabb, mint a Nap közepén. A Jupiter, mint más külső bolygók, többnyire gázból és folyadékokból áll, különösen hidrogénből és héliumból (hasonlóan a Naphoz). Ha szilárd magja lenne, valószínűleg nem lenne nagyobb, mint a Föld. Fölötte több mint 6000 km vastag jégréteg lenne, amely itt nem az alacsony hőmérséklet miatt maradna szilárd állapotban (a Jupiter viszont magas hőmérsékletéről ismert), hanem az óriási nyomás miatt. A bolygó nagy részét olvadt fém hidrogén alkotja. E réteg felett van egy átmeneti zóna, amely átmegy a folyékony molekuláris hidrogénrétegbe. A Jupitert a troposzférában kialakult színes viharfelhők jellemzik. Feltételezzük, hogy az alsó felhőket, akárcsak a Földön, vízgőzök képezik. Még nagyobb felhőtakarót képez az ammónium-szulfát, még nagyobb magasságokban csak a tiszta ammónia.
Körülbelül 60 km-rel a legmagasabb felhőrétegek felett található a troposzféra, amely simán áramlik a sztratoszférába, ahol a hőmérséklet -100 ° C körül mozog. A magasabb rétegben - az ionoszférában - azonban a hőmérséklet ismét emelkedik. A légkör egy összetett rendszer, jól látható vízszintes sávokkal. A Jupiter legjelentősebb képződménye az ún Piros pont. Ez egy téglavörös képződmény, amely körülbelül háromszor nagyobb, mint a Föld. A környezetnél nagyobb nyomású rendszernek tekintik, és hatalmas viharra hasonlít. Magasabban és alacsonyabb hőmérsékleten fordul elő, mint a legtöbb Jupiter-felhő. A nagy vörös folt szinte biztosan annak a következménye, hogy a Jupiter légkörének mélyéből nagy magasságokba emelkedett valamilyen gázáramlás, de az anyag áramlása a foltról elhanyagolható. A több mint 300 éve tartó vihar azonban megváltoztatja intenzitását. A Jupiter trópusi övét rendszeres távolságban lévő képződmények jellemzik. Az északi féltekén is vannak apró barna viharok, amelyek óriási sebességgel forognak az óramutató járásával ellentétes irányba. Ezeket az egységeket csatlakoztatják és leválasztják. A legnagyobb aktivitás a Jupiter felhőben a Nagy Vörös Folt környékén zajlik. Időnként fehér felhőcsík jelenik meg a szélén.
A Voyager repülése után jelentős Jupiter-gyűrűket is találtak, amelyek sokkal kevésbé láthatók, mint a Szaturnusznál, de nagyon vékonyak és keskenyek.