A genetikai laboratórium a prenatális genetikai diagnosztikával, az örökletes betegségek diagnosztikájával és az onkológiai betegségek genetikai diagnosztikájával foglalkozik.
Az onkológiai genetikai diagnosztika területén a szomatikus változatok genetikai elemzését végezzük onkológiai diagnózisokban (onkohematológia, vastagbélrák, méhnyakrák szűrés), a nem onkológiai diagnosztika területén pedig örökletes alapú betegségek diagnosztikájával és megelőzésével, beleértve a prenatális genetikai diagnosztikát.
Onkogenetikai vizsgálatok rákos betegek diagnózisának meghatározása, a kezelés állapotának figyelemmel kísérése és a relapszus kezdetének korai felismerése érdekében az onkológiai szakterületek szakemberei jelzik.
Speciális munkahely vagyunk, amely az onkogenetikai és neonkogenetikai vizsgálatok széles skálájára összpontosít - a legszélesebb a jelenlegi piacon. Sokukat közülük egyedüli munkahelyként végezzük Szlovákiában vagy Közép-Európában. A teszteket úgy választják meg, hogy ne csak ezekhez vezessenek prenatális diagnózis, a termékenységi rendellenességek diagnosztizálása, hanem a kezelés után a rákos betegek kezelésének és monitorozásának alapjává is vált. Célunk, hogy az ügyfelek számára átfogó genetikai diagnózist nyújtsunk a férfi és női meddőségről, amely személyre szabott kezeléshez vezet az adott pár genetikai felszereltsége és igényei szerint.
NGS szekvenálás az onkodiagnosztikában
Az NGS új generációjának szekvenálása jelenleg a klasszikus molekuláris biológiai technikákat váltja fel a tumorok okozati mutációinak kimutatására. Az NGS fő előnye, hogy több tucat gént tesztelnek egyszerre, sokkal rövidebb idő alatt. Az NGS technológia fontos eszköz a magas kockázatú egyének rákszűrésében. Az NGS panel génszekvenálásának lehetőségei az onkodiagnosztikában felhasználhatók a gyors diagnózisra, a betegek megelőző nyomon követésére, személyre szabott terápiára és műtéti profilaxisra.
Okok arra hogy nem onkológiai genetikai tesztek a következők: veleszületett rendellenességek vagy öröklődő betegségek a családban, meddőség - termékenységi rendellenességek, ismételt vetélések, halva születés, onkológiai kezelés utáni tervezett terhesség, családi kapcsolat, terhesség (35 év feletti anyák életkora, ultrahang vagy biokémiai eredmények pozitív eredménye) felderítése vizsgálat, a családban visszatérő öröklődő rendellenességek kockázata, külső hatásoknak - gyógyszerek, ionizáló sugárzás és fertőző betegségek) való kitettség és mások. Klinikai-genetikai vizsgálatot biztosítunk: mindkét partner személyes és családtörténetének elemzése genetikai konzultáció genetikai klinikánkon.
Ma szerves része prenatális genetikai diagnózis genetikailag meghatározott betegségek szűrése is, a prenatális szűrés meghatározott csoportjával non-invazív prenatális vizsgálat (NIPT). A Medirex saját vezető tesztjei révén regionális vezető szerepet tölt be a NIPT területén TRISOMY teszt A TRISOMY tesztek portfóliójában jelenleg választhatunk basic (TRISOMY teszt a TRISOMY teszt XY), valamint a haladó (TRISOMY teszt + a A TRISOMY teszt befejeződött) típusú vizsgálatok különböznek a vizsgált kromoszóma rendellenességek mértékétől. A legismertebb rendellenességek, amelyeket már a TRISOMY alapteszt során is megvizsgáltak a 21., 18. és 13. kromoszóma triszómiája (Down, Edwards és Patau szindrómát okoz). Másrészt a legszélesebb körű teszt A TRISOMY test Complete egy teljes genomvizsgálatot biztosít (a műszaki leírás és a teszt korlátai szerint), amelyben több tucat ismert, többé-kevésbé ismert klinikai szindrómát okozó kromoszóma-rendellenességet vizsgálnak.
A genetikai laboratóriumban a vizsgálatokat három szinten végzik - citogenetika, fluoreszcens in situ hibridizáció a molekuláris diagnosztika. A vizsgálatok széles skáláját állítottuk össze, amelyekkel meghatározzuk a beteg pontos diagnózisát. A pozsonyi Klinikai Genetikai Tanszék 2018 óta hajtja végre a legmodernebb genetikai tesztelést új generációs NGS szekvenszerekkel, amelyek lehetővé teszik a gének, a klinikai exoma vagy a teljes exoma panelvizsgálatát.
Átfogó genetikai diagnosztikát biztosítunk a betegek számára
A genetikai diagnosztikában alkalmazott módszerek
CITOGENETIKA -) Amikor klinikailag gyanítható a citogenetikai aberráció, különféle típusú biológiai anyagokat termesztünk: magzatvíz, korionbolyhok, csontvelő, perifériás vér és szövetek. A tenyésztett anyagok feldolgozásának eredménye a beteg kariotípusa (kromoszómák összessége), amely a kromoszóma-rendellenességek kizárását szolgálja a differenciáldiagnózisban.
FISH - fluoreszcencia in situ hibridizáció
A kóros sejtek mágneses elválasztása - a MACS eszköz segítségével képesek vagyunk elválasztani a kóros plazma sejteket az egész csontvelőből myeloma multiplex (MM) vagy őssejtekben. Az elv abból áll, hogy a sejtek felszínén olyan tulajdonságokat használnak, mint pl. A Syndecan-1 és CD138 + pozitív szelekciót MM-ben alkalmazzuk. Szétválasztással egy vonal sejtpopulációját kapjuk. Az így kapott sejteket tenyészthetjük citogenetikán, vagy közvetlenül elvégezhetjük fluoreszcencia in situ hibridizációt. Előnye, hogy nagy kóros sejteket tartalmazó sejtszuszpenziót kapunk, ami növeli az alkalmazott módszerek érzékenységét és specificitását.
M (többszínű) -HAL - olyan technika, amely hasznos a kicsi, komplex interkromoszómális átrendeződések és az ún a kromoszómák olyan markere, amely a hagyományos citogenetikával nem mutatható ki.
mBAND (többszínű BAND) HAL - a technika előnyös a törések meghatározására, az intrakromoszómális átrendeződések elemzésére, és hasznos lehet rövidebb kromoszómákkal rendelkező készítményeknél.
MOLEKULÁRIS DIAGNOSZTIKA
tömbCGH - A tömb-CGH (komparatív genomi hibridizáció) módszer chip technika. Innovatív megközelítést kínál a kiegyensúlyozatlan változások (törlések/duplikációk) kimutatására, amelyek helye a beteg genomjában nem ismert előre. A módszer százszor érzékenyebb, mint a kariotizálás, ezért a citogenetikai diagnosztikát molekuláris szintre tolja.
- Az aCGH alkalmas nagy felbontású eszköz a genom szubmikroszkópos változásainak kimutatására,
- alkalmazás megtalálható a prenatális és postnatalis diagnosztikában,
- hozzájárul a diagnózis, a megelőzés, a prognózis tisztázásához, a megfelelő kezelés felkutatásához, és diagnosztikai információkat nyújt a prenatális genetikai tanácsadáshoz,
- az alkalmazás lehetősége olyan esetekben is fennáll, amikor a tenyésztés (amniociták) kudarcot vall,
- lehetővé teszi más PCR módszerek (NGS, QF-PCR, MLPA) nem egyértelmű megállapításainak megoldását.
Multiplex ligációfüggő szondaerősítés (MLPA) - a kvantitatív multiplex PCR-en alapuló módszer, amelyet a specifikus szekvenciák relatív kópiaszámának kimutatására használnak. Az MLPA módszer segítségével lehetséges a genomiális változások széles körének azonosítása, különösen a gének vagy kromoszómák kiterjedtebb deléciói/duplikációi. Jelenleg nagyszámú MLPA készlet áll rendelkezésre különféle genetikai betegségek diagnosztizálására. Mikrodeletiós szindrómák szűrővizsgálati diagnosztikájaként használják, és hematológiai rosszindulatú daganatokban is rendkívüli felhasználásra talált.
ÁBRA. MLPA elemzés - az X és 18. kromoszóma kettős triszómiájának kimutatása.
QF-PCR (kvantitatív fluoreszcencia polimeráz láncreakció)
A QF-PCR módszer alkalmas a leggyakoribb aneuploidiák (13., 18. és 21. kromoszóma) gyors prenatális detektálására és a nemek (X, Y) kimutatására a magzatvíz (PV) sejtek előzetes tenyésztése nélkül. A módszer elve specifikus DNS-szekvenciák (STR rövid tandem ismétlések) szaporítása fluoreszcensen jelölt primerek alkalmazásával. STR - erősen polimorf, rövid tandem ismétlődő markerek, amelyek specifikusak az egyes kromoszómákra. A QF-PCR módszer a specifikus kromoszómapár STR DNS-szaporításával kapott fluoreszcens jelek intenzitásának összehasonlításán alapul. Meghatározzuk az egyes párok és nemi kromoszómák arányát és számát a magzati genomban. A fluoreszcencia jel (csúcs) mutatja az egyén egyedi alléljait. A magasság összehasonlításával (a csúcsterület arányának kiértékelésével) információt kapunk a kromoszómák számáról. A QF-PCR előnye az a képesség, hogy kimutatja az anyai szennyeződést egy PV-mintában, valamint megmutatja az apaságot, az uniparentális diszomiát, és még az ikrek zigozitását is meghatározza.
ÁBRA. Specifikus kromoszómák elektroforetogramma multiplex QF-PCR
A BCR-ABL fúziós gén szintjének figyelemmel kísérése: a cél a minőségi diagnosztika biztosítása a CML-ben szenvedő betegek (krónikus myelocytás leukémia) mély molekuláris válaszának nyomon követésére. Szlovákiában csak 2 laboratórium (Medirex as és NOU) kapott konverziós tényezőt (CF), amelyet az eredmények jelentésére használnak nemzetközi léptékben.
A CML) betegek átfogó diagnózisát végezzük:
- A BCR-ABL gén diagnosztikai vizsgálata multiplex PCR-rel (8féle BCR-ABL-szünet meghatározása (b2a2, b3a2, e1a2, c3a2, b1a1, b3a3, b2a3, a1a3).
- A BCR-ABL átirat molekuláris monitorozása (akkreditált).
- A mutációk kimutatása a BCR-ABL kináz doménjében.
Farmakogenomikai vizsgálatok: Farmakogenomikus teszteket használnak az egyéni érzékenység tesztelésére egy adott kezelésre. Egyeseknek nagyobb adagokra lehet szükségük ahhoz, hogy hatékonyak legyenek, míg mások mellékhatásokat tapasztalhatnak a szokásos gyógyszeradagokhoz képest. A Medirex 2013. december 1. óta számos farmakogenomikai vizsgálatot kínál (5FU, CYP2D6, TPMT, IL-6).