A különböző morfológiai és fiziológiai változékonyság és rugalmasság lehetővé teszi a gombák előfordulását a különböző ökológiai rendszerekben a talajban, a vízben, a levegőben és az élelmiszerekben.
A mikromicetákat (gombákat) jelentős mértékben használják a modern technológiában gyógyszerek, szerves savak, enzimek, zsírsavak, aminosavak, vitaminok és hasonlók előállításában. A mikromicettek egyes típusai alkalmazhatók a farmakológiai és az élelmiszeriparban. Az egyik legjelentősebb az volt, hogy Sir Alexander Fleming 1929-ben felfedezte a mikromicita Penicillium notatum mikromicete penicillintermékét, és beindította az antibiotikumok korszakát, amely a világot megszabadította a haláltól a fertőző ágensek által okozott veszélyes betegségek széles köréig.
Használat élelmiszer-előállításban
A kulturális mikromiceták törzseit jelentős mértékben használják a modern technológiában fermentált növényi és állati eredetű élelmiszerek előállításához. A mikroszkópos rostgombákat több éve (2000 - 7000 év) használják Ázsiában az erjesztett élelmiszerek gyártásában. Az erjesztett élelmiszerek gyártása Európában és Észak-Amerikában szintén fontos. Az előrecsomagolt sajtok gyártása a római időktől, a Camambert típusú sajtok gyártása a 18. század óta ismert. Dél-Amerika, Észak- és Dél-Afrika területein a rostos mikromicetákat csak ritkán használják erjesztett termékek előállítására. Ázsia nagy lakosságának fehérjével történő biztosítása nagyon nehéz.
A növényi fehérje nagy százaléka szója néven ismert, amelyet ezekben az országokban is széles körben használnak. A szójaalapú ételeket, például a tempeh-t, a tálat, a szufut rostos mikroszkópos szivacsokkal fermentálva dolgozzák fel, és a puffadó cukrok csökkenése miatt jobban emészthetők. A szója kellemetlen érzékszervi tulajdonságait (ízét és illatát) okozó anyagok lebomlása szintén fontos. Ugyanakkor megnövekedett néhány B-vitamin tartalom.Az erjesztési folyamat tartósítószerek használata nélkül meghosszabbítja a termék mikrobiológiai stabilitását, és lerövidül a kulináris elkészítési idő. Az európai országokban a rostos mikromicettek kulturális törzseinek felhasználása elsősorban sajtokat és húskészítményeket állít elő.
Kék sajt
A gombák előfordulása szerint a penészsajtokat két csoportra osztják, nevezetesen a felületen penészesedéssel (ezek Camembert típusú sajtok) és az úton penészesedéssel (Roequefort típusú sajtok). A Penicillium camemberit (Encián, a környező országokban úgynevezett Brie, Camembert és hasonlók) használják Camembert típusú sajtok gyártására. A Penicillium roequoforti kulturális formát penészes sajtok gyártásához használják az úton. Ezek közül az olasz Gorgonzola, a Niva és a francia Rouquefort a legismertebb.
A penész sajtok gyártása mellett mikromicettákat is használnak a sajt felületének kiszáradásától és a nem kívánt mikroflóra növekedésétől való védelem érdekében az alacsony hőmérsékleten hőkezelt sajt technológiai előállításakor. A tenyésztett mikromicettek használata előnyös a húskészítmények ízesítése, a légköri oxigén és a fény elleni védelem, valamint a húskészítmények spontán öntésének és mikotoxinok képződésének megakadályozása szempontjából. A penészbevonatú húskészítmények gyártásának hagyománya főleg Olaszországban és Magyarországon ismert. A Botromis cinerea micromycetes viszont megállítja a szőlő érését, felgyorsítja a víz párolgását, és ezáltal növeli a szőlő cukortartalmát. Franciaul ezeket a mikromicetákat „la pourriture nobie” -nek, Magyarországon „aszu” -nak hívják.
Negatív jelentés
A rostos mikromiceták negatív jelentőséggel bírnak az ételekben is, vagyis az élelmiszer romlását okozzák. A gombákkal és más mikroorganizmusokkal kölcsönhatásba lépve élelmiszer-eredetű fertőzések léphetnek fel. Például a Penicillium és a Clostridium botulinum közötti kapcsolat miatt a gomba jelenléte csökkenti az étel savasságát, lehetővé téve a Clostridium botulinum spórák csírázását és (mérgező méreg) botulinum toxin termelését.
Az élelmiszerekben a toxinogén gombák megfelelő hőmérsékleti és páratartalmi körülmények között képesek létrehozni a mikotoxinok másodlagos metabolitjait, amelyek károsak az emberi egészségre és gyomor-bélrendszeri fertőzéseket okozhatnak (különösen betegekben, idősekben és immunhiányos gyermekeknél). A kórokozó mezei gombák viszont jelentős gazdasági veszteségeket okoznak a növényi eredetű élelmiszerek (rozs, búza) előállításában, és ezáltal élelmiszerhiányt okoznak.