Az első generációhoz képest a Yaris 2-es száma minden irányban kissé növekedett. A test alakja nemcsak esztétikailag, hanem aerodinamikailag is sikeres volt, amikor a Cx légellenállási együttható eléri a 0,30-at. A belső teret a légiesség jellemzi, megjelenésével és műhelymunkájával is örömet szerez. A kemény műanyagok, amelyek hajlamosabbak a különféle karcolásokra, kevésbé izgalmasak az érintésre. A kezelőszervek ergonómiája megfelelő szinten van, a legjelentősebb kihágás a fedélzeti számítógép nem praktikus vezérlése. A szokás szerint a műszerfalat is a műszerfal közepére kell helyezni. A kijelző egy napsütéses napon is könnyen olvasható, de a műszerfal közepére helyezve a vezetőnek figyelnie kell, hogy mi történik a jármű előtt, hogy elmozdítsa a szemét. Meg kell említeni a fejlett kulcs nélküli zár és indító rendszer lehetőségét. Míg a klasszikus zár megmaradt az ajtókilincseken, a belső térben már nincs kártyahely, mivel a rendszer nagy távolságú kommunikációval működik. Csak nyomja meg az indító gombot, és a motor beindul. Ha a rendszerben az akkumulátor lemerült, akkor a kártyát az indítógomb közelébe kell helyezni, majd el kell indítani.
A csomagtér alapelrendezése 272 liter. Mint már említettük, a hátsó ülések hosszirányban 150 mm-rel elmozdíthatók, míg a szélesebb és keskenyebb rész egymástól függetlenül mozgatható. A csomagtér is sokat fog nőni. Ha a hátsó üléseket előre mozgatják, a legénység 363 litert kap, és összecsukása után 737 liter térfogatú, sík padlós tér jön létre az ablakok alsó széléig, 1183 literig. Az alaptérfogat növekedése nemcsak a jármű teljes méreteinek növekedésével, hanem a hátsó tengely újratervezett felépítésével is jár, amely most 45 mm-rel alacsonyabb, mint az első generáció. További 50 liter kis poggyászért van elrejtve a padló alatt. A hatchback előnye a szedánnal szemben a poggyászhoz való jó hozzáférés is, de a Yarisa-ban a magas rakodóél és a fedélnyílás alacsony magassága kissé megsérti. A belső térben található rengeteg tárolóhely különféle apróságok tárolására szolgál.
A második generációs Yaris vezetési tulajdonságait az osztályon belül nagyon jónak lehet értékelni. Noha a magas karosszéria kissé jobban megdől, és a vezető, egyre magasabbra ülve, kétszer érzi minden fordulatot vagy egyenetlenséget, ennek ellenére a futómű nagyon jó kompromisszumot kínál, szilárd kényelemmel és kellemes biztonsággal. Míg a régi Yarisban az agilitás és a fordulási hajlandóság meghaladta az átlagot, a gyors menet közbeni iránystabilitás és bizonyosság esetén már kissé a rövidebb vég mögött húzódott. A rövid és magas karosszéria megtérült, és a gyors vezetés, különösen erős széllel vagy egyenetlen utakon, állandó kisebb beállításokat igényelt. A Yaris II ebben a tekintetben különbözik, és lényegesen jobban kell szállítani. Még mindig szereti a sarkokat, és örömmel járja végig őket, köszönhetően a jól hangolt futóműnek és a megfelelő súlyelosztásnak, különösen a könnyű benzinmotorok esetében. Ezenkívül nagyobb bizonyosságot adott nagyobb sebességnél a hosszú egyenes szakaszokon. Így az oldalszél vagy a hosszanti egyenetlenségek kevésbé befolyásolják a vezetést, mint korábban. A standard 14 ″ (15 ″) kerekek (korábban 13 ″) szintén szerepet játszanak a nagyobb stabilitás szempontjából. Az egyenlőtlenségek szilárd csillapítását és a futómű hangszigetelését is értékelni kell.