Az ételintolerancia inkább az emésztőrendszer, mint az immunrendszer reakciója.
Eredete szorosan összefügg a vékonybél emésztési folyamatával és a bél nyálkahártya-gátjának rendellenességeivel. Az emésztési folyamat során, mielőtt bekerülne a véráramba, az étrendben lévő fehérjék kisebb részekre (peptidekre) bomlanak, amelyeket általában tovább aminosavakra bontanak. Az ételintolerancia során nagyobb peptidek is bekerülnek a véráramba. Az immunrendszer észleli őket és megtámadja őket, ami egyes egyéneknél növekedést okozhat IgG antitestek termelése. A "pszeudoallergia" számos immunválaszhoz kapcsolódik, amelyek mindegyikét nem tudjuk diagnosztizálni, de hosszan tartó és krónikus egészségügyi problémákat okozhat. Diagnosztikára használják őket specifikus IgG antitestek, amelyek a legfrissebb kutatások szerint nem az egyetlen ok a "pszeudoallergia" tüneteire, hanem felhasználhatók annak diagnosztizálásában.
Ez a keringő élelmiszer-antigének - specifikus IgG antitestek enzimes meghatározása a szérumban egyes élelmiszerek ellen: