Heydrich a Cseh és Morvaországi Protektorátus birodalmi védelmezője volt. Heinrich Himmler SS-vezér ezen közeli munkatársa a holokauszt egyik legnagyobb szervezője is volt. 1942 januárjában konferenciát vezetett Wannsee-ben, ahol zsidók millióinak kiirtásáról döntöttek a Majdanek, Auschwitz, Treblinka stb. Koncentrációs táborokban. Kedvenc volt. A történészek a nácizmus egyik legsötétebb alakjának tartják. 1941-ben Csehországba érkezett azzal a egyértelmű céllal, hogy a cseheket németekké tegye. Ezért részletes leírása volt a protektorátus lakóinak faji összetételéről. "Különféle módszerekkel, különféle eszközökkel lehetőséget kell adni arra, hogy a teljes népességet faji és nemzetiségi szempontból értékeljem. Akár röntgen, iskolai bemutatók segítségével, akár a fiatalok faji tesztelésével "- mondta hivatalba lépésekor.
Emellett több háborús történész egyetért abban, hogy Heydrichnek rendet kellett teremtenie Csehországban. Ezért több cseh tábornokot kivégeztetett, ami feldühítette a londoni száműzetésben lévő kormányt. Nyilvánvalóan ez váltotta ki a merénylet előkészületeit.
Az Anthropoid hadművelet - Hedrich meggyilkolásának nevezték - megakadályozta Heydrichet abban, hogy buzgón foglalkozzon a holokauszt és a Protektorátus németesítésével. Ezért Nagy-Britanniában külön egységet hoztak létre, amelynek célja a gyűlölt náci meggyilkolása volt. A merényletre 1942. május 27-én került sor Prágában. Heydrich július 4-én belehalt sérüléseibe. Halála után a nácik bosszúként kitörölték Lidice és Ležáky falvakat a világtérképről.
Ennek ellenére számos történész pozitívan értékeli a merényletet, mert azt állítják, hogy a holokauszt atyja meghalt. "Reinhard Heydrich volt az emberiség történelmében az egyik legnagyobb tömeggyilkos, ha nem is a legtömegesebb" - mondta Michal Burian hadtörténész a Mladá fronta Dnes-nek. Egy másik történész, Jan Boris Uhlíř szerint a polgári lakosság meggyilkolásának következményei olyan szörnyűek voltak, mert a csehek rendkívül fontosak voltak számukra, és meg kellett tartani bennük a rendet: nem történtek meg. "